Composition du microbiote, fonctions et où est

La microbiote normal des êtres humains est l'ensemble des micro-organismes qui habitent le corps de manière standard, sans causer de maladie. Aujourd'hui, il est considéré que le terme flore bactérienne est inapproprié.

Taxonomiquement, le microbiote est composé d'organismes très divers, des bactéries, des arches et des eucaryotes aux virus. Les communautés microbiennes varient considérablement dans différentes zones corporelles. C'est-à-dire que la composition des microbes dans la bouche ne correspond pas à ce que nous trouvons dans l'intestin.

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Lorsque nous pensons aux bactéries - et aux micro-organismes en général - nous évoquons généralement des sentiments péjoratifs en présence de ces entités dans notre corps. Bien qu'il soit vrai que plusieurs bactéries provoquent des maladies graves, la généralisation de cette conception n'est pas correcte.

Les micro-organismes dans notre corps sont indispensables et établissent des mutualistes et des dîners avec notre corps. Notre microbiote a un impact significatif sur notre physiologie - à la fois directement et indirectement - contribue à d'innombrables fonctions métaboliques, nous protégez contre les agents pathogènes, éduque le système immunitaire, entre autres fonctions.

Différents facteurs affectent la composition du microbiote humain. Parmi les plus importants figurent le régime alimentaire - tant dans le temps des nourrissons et des adultes - le mode de naissance, l'utilisation d'antibiotiques, certaines conditions médicales, le génotype des invités, entre autres.

Il existe actuellement une série de nouvelles méthodes moléculaires qui permettent à la caractérisation du microbiote grâce à des techniques de séquençage avancées et rapides. Le plus utilisé est le gène qui code pour l'ARN ribosomal 16S et se compare à une base de données.

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Quel est le microbiote?

Le microbiote est défini comme l'assemblage de micro-organismes présents dans un environnement défini. Dans ce cas, les micro-organismes associés au corps de l'être humain. Le terme a été proposé par Lederberg et McCray, qui ont souligné les conséquences et les avantages de ces entités biologiques à la santé humaine.

Il y a un terme très similaire: microbiome. Dans la littérature, le microbiome et le microbiote, ce sont généralement des concepts interchangeables. Cependant, si nous voulons être un microbiome précis est le catalogue des microbes, avec leurs gènes.

Un terme associé est la "flore" bactérienne, la microflore ou la flore intestinale. Les deux ont été utilisés depuis plusieurs décennies et ont été particulièrement pertinents dans la littérature médicale et scientifique.

Cependant, ce terme datant de 1900 est inapproprié, car Flora est un terme dérivé du latin fleur, associé aux plantes qui habitent une région particulière. Et comme une référence n'est pas faite à l'ensemble des microplants qui habitent le corps de l'être humain, le terme doit être abandonné et remplacé par le microbiote ou le microbiome selon le cas.

Composition de microbiote normale

Le numéro

Le microbiote se compose de multiples micro-organismes qui habitent le corps de chaque personne. En termes numériques, il y a entre 10 et 100 milliards (dépassant le nombre de cellules invités) de ces organismes symbiotiques, qui sont principalement situés dans le tractus gastro-intestinal.

Facteurs qui affectent la composition du microbiote

Le microbiote commence à se former à partir de la naissance du bébé, où son corps représente une nouvelle atmosphère pour la colonisation microbienne. Cette colonisation dépend du mode de naissance - c'est-à-dire une section naturelle ou césarienne (cette dernière affecte considérablement le microbiote).

À mesure que le nourrisson grandit et se développe, la diversité du microbiote augmente linéairement, selon les premiers colonisateurs. Cela changera en fonction d'un large éventail de facteurs, tels que l'alimentation du lait maternel, la consommation de certains aliments, le développement des maladies, entre autres.

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Les recherches actuelles suggèrent que le régime alimentaire est le facteur le plus important qui aide à déterminer le type de microbiote qui existera chez chaque individu.

Taxonomie

Taxonomiquement, ces micro-organismes appartiennent aux trois domaines de la vie: eucaryotes, bactéries et arches.

L'identité de ces organismes est largement variable entre les individus, les régions corporelles du corps et la zone géographique où il vit. Dans la section suivante, nous décrirons plus l'identité taxonomique du microbiote typique de chaque région du corps.

Alors sommes-nous vraiment humains?

Maintenant, connaissant l'énorme diversité des organismes qui habitent notre corps, nous devons demander qui nous sommes et si nous pouvons vraiment nous considérer comme un individu.

Une vision plus appropriée consiste à nous considérer comme un superorganisme ou un holobionte, car nous composons 90% de cellules microbiennes et 99% des gènes des microbes.

Où est-il situé?

Notre corps est un riche assemblage de micro-organismes, où chaque structure fournit un créneau potentiel pour le développement de ces. Ces relations mutuelles sont généralement un site spécifique, où un certain ensemble de micro-organismes forme des colonies dans des régions du corps spécifiques. Les régions les plus importantes sont:

Microbiote intestinal

Dans les niches fournies par le corps humain, il ne fait aucun doute que le mieux étudié - en termes de microbiote - est le tractus gastro-intestinal.

Dans l'intestin d'un individu adulte, il existe des milliers d'espèces, dominées par Phyla bacteroides, Firmicutes, Actinobacteria, Proteobacteria et Verruchomicrobia.

Cette colonisation varie le long du tube digestif. Dans l'intestin grêle, les Lactobacillaceae, Erysiopelotrichacea et Enterobacteriace, riches dans les genres prédominent Bactérides spp., Clostridium spp., Bifidobacterium spp

Dans le côlon, les habitants les plus courants sont les Bacteroideceae, les Prevotellaceae, les Rikenellaceae, les Lachniraceae et les Ruminococaceae.

Cette différence dans la famille des bactéries tout au long de l'intestin reflète les différences physiologiques qui existent tout au long.

Dans l'intestin grêle, la croissance bactérienne est limitée par la concentration en oxygène, la présence de peptides antimicrobiens et les valeurs de pH, tandis que dans le côlon, la charge bactérienne est plus élevée.

De plus, il existe une restriction bactérienne dans l'intestin grêle pour éviter la compétence dans l'absorption des nutriments entre les micro-organismes et l'hôte.

Dans les excréments, les principaux détectés appartiennent au domaine des bactéries, bien qu'il y ait également des représentants des arches (ordre méthanobactérien) et des eucaryotes (ordre des saccharomycètes.)

Microbiote oral

La cavité buccale et les extensions adjacentes représentent des régions d'hébergement adéquates pour certains types de micro-organismes, y compris la surface dentaire, la surface de la langue et d'autres structures kératinisées et non kératinisées.

Une composante fondamentale de la cavité buccale est la salive. Dans un millilitre de ce liquide, nous pouvons trouver jusqu'à 100 millions de cellules bactériennes. Parmi ceux-ci, environ 300 espèces ont été identifiées, tandis que 360 ​​autres n'ont pas été attribués d'identité taxonomique spécifique.

Le phylum domine la cavité buccale Firmicutes, suivi de Protéobactéries, bactérioïdes, actinobactéries, spirochaetes et Fusobactéries.

Quant à la diversité des arches, le genre Méthanobrévibacter Il a été isolé à plusieurs reprises de la cavité orale.

Des études révèlent que la présence d'arches est liée au développement de maladies parodontales. De cette façon, le rôle de ces organismes dans l'établissement de relations avec les clients avec les invités n'est pas encore clair.

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Le champignon qui domine dans la cavité buccale appartient au genre Candidose. Comme les espèces d'Arches, elles ont été liées au développement de maladies multiples. Les autres genres courants dans la cavité sont: Cladosporium, auréobasidium, saccharomycetals, aspergillus et Fusarium.

Enfin, les virus les plus courants dans la bouche sont l'herpèsvirus. On estime que 90% de la population les possède.

Microbiote urogénital

Tracts urogénitaux féminins

Les microbes qui habitent à l'intérieur du vagin se trouvent dans une association fine et équilibrée du type mutualiste, protégeant leur invité et échangent des nutriments, en échange d'un environnement anxice approprié pour sa croissance.

Chez les femmes en âge de procréer, le vagin contient des quantités importantes d'acide lactique et d'autres substances antimicrobiennes, ce qui limite la croissance du microbiote. Cet environnement est maintenu grâce à la présence de bactéries productrices de l'acide lactique, en particulier Lactobacillus spp.

En fait, les bactéries appartenant à ce genre sont considérées depuis 1892 comme des habitants indispensables pour la santé vaginale.

En plus de Lactobacillus, Le vagin se caractérise par la présentation des micro-organismes des genres: Staphylococcus, Ureaplasma, Chorynebacterium, Streptococcus, Peptostreptococcus, Gardnerella, Bacteroides, Mycoplasma, Enterococcus, Escherichia, Veillonella, Bifidobacterium Et le champignon Candidose.

Alors que les femmes augmentent en âge et que les niveaux hormonaux fluctuent, le microbiote est modifié.

Tractus urogénital masculin

Comparé au tractus urogénital femelle, le microbiote mâle a été peu étudié et n'est pas connu en détail.

Certains des genres qui ont été signalés dans le pénis comprennent Staphylococus epidermidis, Chorynebacterium spp., Lactobacillus spp., entre autres.

Microbiote pulmonaire

Les poumons ont été des organes d'un grand intérêt pour l'étude de son microbiote. Cependant, il existe des études très limitées sur le sujet - associées à la difficulté de prélever des échantillons. Bien que des zones auparavant stériles aient été prises en compte, cette vision a été modifiée aujourd'hui.

La présence de genres a été trouvée Streptocoque, Et dans certains échantillons Haemophilus, Rothia, Prenetella, veillonella et Fusobacterium.

Microbiote cutané

Le plus grand organe d'humains est la peau, qui est couverte d'une grande diversité de micro-organismes et est colonisée par celles-ci à partir du moment de la naissance.

Environ 200 genres bactériens ont été identifiés qui sont considérés comme des résidents de la peau. La plupart de ces espèces appartiennent à trois phyla, à savoir: actinobactéries, firmicutes et protéobactéries.

La composition du microbiote cutané est étroitement liée au type de peau, aux habitudes et à la génétique de l'hôte, donc c'est extrêmement variable.

La plupart des microbes se nourrissent de sécrétions cutanées, ils établissent donc des relations très étroites.

Les fonctions

Digestion et production de vitamines

Le microbiote remplit une série de fonctions dans le corps humain, mettant en évidence son rôle dans l'amélioration de la digestion.

Les bactéries qui habitent à l'extrémité du côlon sont liées au fractionnement des polysaccharides qui ne sont pas efficacement métabolisés dans l'intestin grêle, ce qui augmente l'absorption des nutriments.

Il a également été mis en évidence que différentes bactéries sont capables de produire des vitamines indispensables qui seront absorbées par l'hôte. Un exemple de cela est l'une des agences les plus connues par les scientifiques: ET. coli.

Compétence et protection contre les agents pathogènes

La compétition est définie comme une interaction antagoniste qui implique deux espèces ou plus qui rivalisent pour obtenir une ressource commune.

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Le spectre des micro-organismes inoffensifs que nous hébergeons dans notre corps est en concurrence constante avec les agents pathogènes et, dans la plupart des cas, ils parviennent à les déplacer - grâce à ce qui est connu comme un principe d'exclusion compétitive.

On pense qu'ils établissent la première ligne de défense contre l'infection de ces agents pathogènes potentiels.

Comment étudiez-vous le microbiote?

L'étude du microbiote remonte à l'époque d'Antonie van Leewenhoek, au début de 1680. Ce chercheur a étudié de manière comparative les différents micro-organismes qui habitaient dans l'oral et les excréments, remarquant des différences significatives dans les deux domaines.

Les différences sont allées au-delà de la région du corps, puisque ce chercheur a également inclus dans ses comparaisons de conception expérimentale entre des individus sains et malades. De cette façon, il a réussi à montrer l'importance des micro-organismes en santé humaine.

Historiquement, l'étude du microbiote impliquait l'investissement de temps et d'énergie dans la génération de cultures multiples.

À l'heure actuelle, cette méthodologie a été remplacée par une approche moléculaire qui permet d'analyser les séquences génétiques de micro-organismes (généralement le marqueur moléculaire utilisé est le gène de l'ARN ribosomal 16S et 18S.)

En analysant ces séquences, le taxon (eucaryotes, bactéries ou arches) peut être attribué à différents niveaux taxonomiques, jusqu'à ce que nous atteignions l'espèce.

Le terme métagénomique a été initialement utilisé pour la caractérisation de l'ADN total, et aujourd'hui est plus précisément utilisé pour se référer à l'étude des marqueurs génétiques, tels que le gène de l'ADN ribosomal 16S.

Que se passe-t-il lorsque les déséquilibres se produisent dans le microbiote?

Bien qu'il n'y ait pas de schéma clair et précis de tous les organismes qui habitent le corps humain, il est connu que le changement d'abondance et de composition du même affecte la santé, des troubles de la digestion au développement du comportement anxieux.

Actuellement, les traitements axés sur la restauration d'un microbiote sain sont gérés aux patients souffrant de certains troubles.

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