Caractéristiques, structures et fonctions de Ribulosa

La Ribulosa Il s'agit d'un sucre monosaccharide ou de glucides qui contient cinq atomes de carbone et un groupe fonctionnel de la cétone dans sa structure, il est donc inclus dans le groupe de Kétopentiques.

L'église de quatre et cinq atomes de carbone est nommée en insérant l'infixe "Ul”Au nom de l'aldosa correspondant. Ainsi, le d-libuleux est le kétopentosa qui correspond au d-libose, un aldopentosa.

Projection de Fisher pour la ribulosa (source: Neurotoger [domaine public] via Wikimedia Commons)

Ce sucre participe à la forme D-Libule comme un intermédiaire dans diverses routes métaboliques, comme dans le cycle Calvin, par exemple. Tandis que seuls dans certains genres bactéries telles que Acétobacter et Gluconobacter L-libose est obtenu en tant que produit métabolique final. Pour cette raison, ces micro-organismes sont utilisés pour leur synthèse au niveau industriel.

Certains composés dérivés de la ribulose sont des principaux composés intermédiaires sur la route du pentose phosphate. Cette voie est destinée à générer NADPH, un cofacteur important qui fonctionne dans la biosynthèse des nucléotides.

Il existe des mécanismes industriels pour synthétiser le L-lubule. La première méthode d'isolement avec laquelle elle a été obtenue consistait en la méthode d'isolation zèle du levène et de la forge du L-xilosa.

Malgré les grandes avancées des méthodes industrielles pour la synthèse et la purification des composés chimiques, le L-lubule n'est pas obtenu comme un monosaccharide isolé, obtenant en fractions combinées de l-libose et de l-yrabineux.

La méthode pour obtenir la libule la plus utilisée aujourd'hui est la purification de gLuconobacte Frarateurii IFO 3254. Ce type de bactéries est capable de survivre dans des conditions acides et d'avoir une voie d'oxydation du ribitol vers L-Libule.

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Caractéristiques

Ribulous en tant que réactif synthétisé, extrait et purifié que l'on trouve fréquemment comme L-Libulle, est une substance organique solide, blanche et cristalline. Comme tous les glucides, ce monosaccharide est soluble dans l'eau et a les caractéristiques typiques des substances polaires.

Comme cela est commun pour le reste des saccharides, la ribulose a le même nombre d'atomes de carbone et d'oxygène, et deux fois cette quantité dans les atomes d'hydrogène.

La manière la plus courante dont elle peut être trouvée dans la nature Ribulous est en association avec différents substituants et en formant des structures complexes, généralement phosphorylées, telles que le 5-phosphate Ribulous, 1,5 bishphosphate Ribulous, entre autres.

Ces composés agissent généralement comme des intermédiaires et des transporteurs ou des «véhicules» pour les groupes de phosphate dans les différentes voies métaboliques cellulaires dans lesquelles ils participent.

Structure

La molécule Ribulosa a un squelette central de cinq atomes de carbone et un groupe Cetona en carbone en position C-2. Comme indiqué précédemment, ce groupe fonctionnel le positionne dans Ketosas sous le nom de Ketopentosa.

Il a quatre groupes hydroxyles (-OH) unis aux quatre carbones qui ne sont pas attachés au groupe cétone et ces quatre carbones sont saturés d'atomes d'hydrogène.

La molécule Ribulle peut être représentée en fonction de la projection de Fisher sous deux formes: d-lubuleux ou libuleux, la forme étant le stéréoisomère et l'énantiomère de la forme d et vice versa.

La classification de la forme D ou L dépend de l'orientation des groupes hydroxyles du premier atome de carbone après le groupe Cetona. Si ce groupe est orienté vers le côté droit, la molécule au nom de Fisher correspond au d-lubuleux, sinon s'il est situé sur le côté gauche (l-libuleux).

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Dans la projection de Haworth, la ribulose peut être représentée dans deux structures supplémentaires en fonction de l'orientation de l'hydroxyle de l'atome de carbone anomérique. En position β, l'hydroxyle est orienté vers la partie supérieure de la molécule; Tandis que la position α guide l'hydroxyle vers le bas.

Ainsi, selon la projection de Haworth, quatre façons possibles peuvent être prises: β-D-Libule.

Projection de Haworth pour Ribulofuranosa (Source: Neurotokeker [domaine public] via Wikimedia Commons)

Les fonctions

Voie du pentose phosphate

La plupart des cellules, en particulier celles qui se trouvent dans une division rapide et constante, telles que les morses osseuses, la muqueuse intestinale et les cellules tumorales, utilisent un phosphate de bibuleux-5, qui est isomérisée au ribose-5-phosphate dans le chemin oxydatif du phosphate de pentose , pour produire des acides nucléiques (ARN et ADN) et des coenzymes tels que l'ATP, NADH, FADH2 et Coenzima A.

Cette phase oxydative du pentose phosphate comprend deux oxydations qui convertissent le 6-phosphate de glucose en ribulose 5-phosphate, réduisant le NADP + en NADPH.

De plus, le ribulosa-5-phosphate actif indirectement.

Cycle Calvin

Le cycle Calvin est le cycle de fixation du carbone qui se déroule dans les organismes photosynthétiques après les premières réactions de la photosynthèse.

Il a été prouvé par des méthodes de marquage dans les essais réalisés par différents chercheurs, qui en marquant le carbone en position C-1 de la ribulosa-1,5-biphosphate, le dioxyde de carbone est fixé dans cet intermédiaire pendant l'origine du cycle de Calvin à deux Molécules de 3-phosphoglycérate: une marquée et une sans marquer.

The Rubisco (Ribulosa 1.5-bishoposphate carboxylase/oxygenase) is considered the most abundant enzyme of the planet and uses as a substrate the ribulous 1.5-bishosphate, to catalyze the incorporation of carbon dioxide and the production of 1.3-diffoglycerate In the Calvin cycle.

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La rupture de cet intermédiaire instable, 1,3-diffoglycérate, de six atomes de carbone, est également catalysée par Rubisco, qui est la médiation de la formation de deux molécules de 3 atomes de carbone (3-phosphoglycérate).

Fonctions dans les bactéries

L'enol-1-SOIT-Carboxyphénylam. Dans cette étape, une molécule de dioxyde de carbone et une d'eau sont libérées, produisant également une molécule indol-3-glycérol-phosphate.

Les bactéries utilisent également le L-Libule sur les routes utilisées pour le métabolisme de l'éthanol. De plus, ces micro-organismes ont une enzyme connue sous le nom d'isomérase L-arabineuse, qui modifie arabineuse pour synthétiser le l-lubuleux.

L-libulose quinasa phosphoryila Ce métabolite en aval pour former du L-5-phosphate, qui peut entrer sur le chemin du pentose phosphate pour la production de sucres pour les squelettes d'acides nucléiques et d'autres molécules essentielles.

Les références

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