Genotype des caractéristiques, norme de réaction, détermination

Il génotype Il est défini comme l'ensemble des gènes (avec leurs allèles) qu'ils codent pour une caractéristique ou une caractéristique particulière, qui se distingue des autres par une fonction ou une séquence spécifique. Cependant, certains auteurs le définissent également comme la partie du génome qui donne naissance au phénotype ou comme la constitution allélique d'un organisme.

Bien que liés, les termes génotype et phénotype ne sont pas la même chose. En ce sens, le phénotype est défini comme l'ensemble des caractéristiques visibles d'un organisme qui sont le résultat de l'expression de ses gènes, et du génotype comme l'ensemble des gènes qui se traduit par un phénotype particulier.

Génotype et phénotype (source: National Human Genome Research Institute [Domain public] via Wikimedia Commons) Le génotype n'est qu'un des facteurs impliqués dans l'établissement du phénotype, car l'influence de l'environnement et d'autres éléments épigénétiques qui ne sont pas directement liés à la séquence nucléotidique moule également les caractéristiques visibles des individus.

Ainsi, deux organismes ont le même génotype s'ils partagent les mêmes ensembles de gènes, mais il n'est pas vrai pour deux organismes qui partagent apparemment le même phénotype, car des caractéristiques similaires peuvent être le produit de gènes différents.

C'est le botaniste danois Wilhelm Johansen, en 1909, qui a introduit pour la première fois dans Science les termes génotype et phénotype, dans un manuel qu'il a intitulé "Les éléments d'une théorie sur l'héritage exact ", qui était le produit d'une série d'expériences qui ont effectué un passage de lignes pures d'orge et de pois.

Ses œuvres, probablement inspirées par celles faites quelques années plus tôt par Gregorio Mendel, considérées comme "Père génétique», Lui a permis de préciser que le génotype d'un organisme donne naissance au phénotype à travers différents processus de développement et sous l'influence de l'environnement.

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Caractéristiques

Le génotype n'est pas exactement le même que le génome. Voici la distinction entre les deux concepts:

- Le "génome" fait référence à tous les gènes dont un individu a hérité de leurs parents et comment ils sont distribués dans les chromosomes dans le noyau.

- Le "génotype" est le terme utilisé pour se référer, par exemple, à l'ensemble des gènes et à leurs variantes qui donnent naissance à une caractéristique particulière, qu'un individu se distingue dans une population ou une espèce.

Pese a que es propenso a sufrir cambios debidos a mutaciones a lo largo de la historia vital de un organismo, el genotipo es un rasgo relativamente invariable de los individuos, puesto que, en teoría, los genes que se heredan son los mismos desde la concepción à mort.

Dans une population naturelle, les allèles qui composent un génotype donné ont des fréquences d'apparence différentes; Autrement dit, certains apparaissent dans les populations plus que d'autres et cela concerne, entre certaines choses, avec la distribution, les conditions environnementales, la présence d'autres espèces, etc.

Le terme "génotype sauvage»Définit la première variante allélique trouvée dans la nature, mais ne fait pas nécessairement référence à l'allèle trouvé plus fréquemment au sein d'une population; et le terme "génotype Mutant"Il est actuellement utilisé pour définir ces allèles différents de la nature.

Pour écrire un génotype, des majuscules et des minuscules sont généralement utilisés, afin de différencier les allèles qu'un individu possède, qu'ils soient homozygotiques ou hétérozygotes. Des lettres majuscules sont utilisées pour définir les allèles dominants et minuscules pour les récessifs.

Règle de réaction du génotype

Les individus héritent des gènes de leurs parents, mais pas les produits finaux qui sont obtenus de leur expression, car ils dépendent de nombreux facteurs externes et de l'histoire de leur développement.

Selon cela et se référant uniquement à des facteurs environnementaux, un génotype peut conduire à plus d'un phénotype. L'ensemble des «résultats» possibles de l'interaction d'un génotype spécifique avec différents environnements est ce que les scientifiques ont appelé la «règle de réaction du génotype».

La norme de réaction d'un génotype est donc une sorte de «quantification» ou d'enregistrement des caractéristiques visibles obtenues à partir des interactions d'un génotype avec certains environnements. Il peut être exprimé en graphiques ou tables qui "prédisent" les résultats possibles.

Il est évident, bien sûr, que la norme de réaction se réfère uniquement à un génotype partiel, à un phénotype partiel et à quelques facteurs environnementaux, car dans la pratique, il est très difficile de prédire absolument toutes les interactions et tous les résultats de ces résultats.

Comment le génotype est-il déterminé?

Déterminer le génotype ou le «génotipify» un organisme ou une population d'individus de la même espèce, fournit de nombreuses informations précieuses concernant sa biologie évolutive, sa biologie de la population, sa taxonomie, son écologie et sa diversité génétique.

Dans les micro-organismes tels que les bactéries et les levures, car ils ont des taux de multiplication et de mutation plus élevés que la plupart des organismes multicellulaires, déterminant et connaissant le génotype permet de contrôler l'identité des colonies dans les collections, ainsi que d'établir certaines caractéristiques de l'épidémiologie, de l'écologie et de la taxonomie du même.

Pour déterminer le génotype, il est nécessaire d'obtenir des échantillons de l'organisme avec lequel vous souhaitez travailler, et les types d'échantillons nécessaires dépendront de chaque organisme. Chez les animaux, par exemple, des échantillons de différents tissus peuvent être prélevés: queue, oreilles, excréments, cheveux ou sang.

Le génotype d'un organisme peut être déterminé expérimentalement grâce à l'utilisation de certaines techniques modernes, qui dépendra de l'emplacement génomique des gènes pour étudier, le budget et le temps, la facilité d'utilisation et le degré de performance souhaité.

À l'heure actuelle, les techniques utilisées pour la génotipfication d'un organisme comprennent, très souvent, l'utilisation et l'analyse des marqueurs moléculaires pour détecter les polymorphismes dans l'ADN et d'autres techniques plus avancées qui impliquent le séquençage du génome.

Plus de marqueurs d'employés

Parmi les marqueurs les plus utilisés, nous trouvons ce qui suit:

- RFLPS (polymorphismes des fragments de restriction).

- AFLPS (polymorphismes de longueur des fragments amplifiés).

- RAPDS (ADN polymorphe amplifié au hasard).

- Microsatellites ou SSR (séquence simple répétée).

- Asaps (amorces associées à des allèles spécifiques).

- SNP (polymorphismes nucléotidiques simples).

Techniques qui utilisent le séquençage et l'hybridation

Et parmi les techniques qui utilisent un séquençage spécifique et une hybridation de sondes spécifiques sont:

- Séquençage par la méthode de Sanger.

- Générotipfication haute performance.

- Répétition "Porte dorée”D'illumina.

- Génotipification du séquençage (GBS).

- Essai de Taqman.

- Séquençage de nouvelle génération.

- Microarreurs.

- Séquençage complet du génome.

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